Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Efnb1P52795 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms