Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SftpdP50404 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms