Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VdrP48281 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VdrP48281 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms