Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms