Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NodalP43021 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NodalP43021 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NodalP43021 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NodalP43021 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NodalP43021 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NodalP43021 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NodalP43021 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms