Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx1-2P42580 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms