Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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