Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rom1P32958 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rom1P32958 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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