Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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