Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcdP28867 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms