Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PdgfraP26618 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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