Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U2af2P26369 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms