Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3aP23116 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms