Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tap1P21958 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tap1P21958 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tap1P21958 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tap1P21958 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tap1P21958 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tap1P21958 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tap1P21958 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tap1P21958 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tap1P21958 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms