Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rag1P15919 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rag1P15919 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rag1P15919 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms