Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P10404 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P10404 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P10404 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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