Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BlmO88700 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BlmO88700 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms