Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nsd1O88491 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nsd1O88491 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms