Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lnx1O70263 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lnx1O70263 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lnx1O70263 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lnx1O70263 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lnx1O70263 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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