Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Slc18a3O35304 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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