Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx3O35160 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms