Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20939L7N243 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20939L7N243 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20939L7N243 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20939L7N243 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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