Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm21310J3QQ23 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm21310J3QQ23 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm21310J3QQ23 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm21310J3QQ23 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm21310J3QQ23 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm21310J3QQ23 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm21310J3QQ23 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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