Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC024978J3QPC3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms