Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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