Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd50F7BE84 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ankrd50F7BE84 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd50F7BE84 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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