Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5478D3Z6R0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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