Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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