Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms