Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms