Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scn3aA2ASI5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn3aA2ASI5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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