Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CtcflA2APF3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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