Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms