Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ubl3Q9Z2M6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ubl3Q9Z2M6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ubl3Q9Z2M6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ubl3Q9Z2M6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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