Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms