Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VarsQ9Z1Q9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VarsQ9Z1Q9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms