Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms