Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VapbQ9QY76 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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VapbQ9QY76 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VapbQ9QY76 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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