Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smco4Q9JIS3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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