Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DysfQ9ESD7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms