Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms