Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa8Q9DCJ5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms