Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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