Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms