Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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