Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Znf580Q9DB38 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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