Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms