Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ift43Q9DA69 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ift43Q9DA69 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ift43Q9DA69 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ift43Q9DA69 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ift43Q9DA69 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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