Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgm5Q9D7I9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms