Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms